历史沿革：

1950年10月：设立公营福建水运公司，经营闽江榕延线客货运输业务。

1951年5月，福建省政府采取购赎政策，将私营福建轮船股份有限公司并入公司，闽江上游轮船运输全归国营。

1952年7月，更名为国营华东内河轮船公司福建省公司，接收了公营裕生公司、闽海船务行、闽候专区、南平专区的船舶。

1953年5月，公司更名为“国营福建省内河轮船公司”。

1954年4月，贯彻中央精简机构精神，公司与其他机构整合成立福建省航运管理局，福建省航运管理局为政企合一的国营运输单位。

1979年7月：福建省航运管理局对外增称：福建省轮船公司

1985年7月：撤销福建省航运管理局，正式成立福建省轮船公司

1986年11月：更名为福建省轮船总公司至今。

航线拓展：

1950年，公司设立之初，经营闽江榕延线客货运输业务，是闽江上游的内河船公司。

1958年，成立福州外海大队，上海海运局10艘轮船、200余名船员下放、充实外海大队,公司国内沿海货物运输初具规模。

1978年，营运航线主要是省内和闽、浙、沪、粤与香港之间。

1984年9月15日，万吨级“大屏山”轮，穿越马六甲海峡，到达马来西亚科伦坡，实现了省轮人近洋航海的宿愿。

1988年4月， 2.8万吨的“金润”轮进入香港租船市场，从上海远航古巴，进而实现省轮人远洋航海的宿愿。

1988年7月，“大金山”轮首次运载电煤抵电厂专用码头，标志着我司向专业化运输迈出了重要一步。

1989年3月，公司与华能福州电厂在北京签订煤炭运输长期合同，标志公司具备承运大宗散货运输的能力，同时为企业的发展奠定了可靠的货运市场基础。

1990年9月1日，“太武山”轮开辟福州－日本长崎直达货运航线，这是我省第一条外贸近洋航线。

1992年8月，2万吨级散货船“金湖”轮首航中欧，谱写了公司司远洋航行的新篇章。

1994年12月9日，“福建”号客轮正式开通福州至香港海上客运直达航线，恢复了断航近40年的福州至香港海上客运航线

1997年4月8日，我司成为首批拥有两岸试点直航经营权的6家大陆航运企业之一；集装箱船“珠峰山”轮首航福州－高雄。

2008年，台湾海峡两岸直航，12月15日公司“金海缘”轮于上午10时30分满载2.4万吨河砂从福州港青州码头出发直航台北，拉开福州港对台散货运输直航序幕。晚间9时15分船舶抵达台北港，成为两岸直航第一艘抵台的船舶。

运力发展：

1950年公司：船舶5艘，106载重吨，105客位。

1951年5月，福建省政府采取购赎政策，将私营福建轮船股份有限公司并入公司。公司拥有轮船75艘，719载重吨5803客位

1952年7月，更名为国营华东内河轮船公司福建省公司，共有船舶79艘，后又接收了公营裕生公司、闽海船务行、闽候专区、南平专区船舶共6艘，公司拥有运力86艘，8223载重吨。

1960年，公司共有沿海货轮68艘，22662总载重吨，海运船队初具规模。

1978年12月，公司拥有运输船舶267艘，42682载重吨。其中，沿海运输船舶92艘，32654载重吨。

1980年12月，公司拥有运输船舶198艘，76485载重吨。其中，沿海运输船舶 86 艘，74160载重吨。

1990年12月，公司拥有运输船舶82艘，25.53万载重吨。其中，沿海、近洋运输船舶68艘，载重吨25.53万载重吨。

1993年12月，随着公司购入一艘1.7万吨散货轮，公司运力规模达到49.6万载重吨的历史高点。

2000年12月，公司拥有运输船舶40艘，36.5万载重吨。其中，沿海、远洋运输船舶38艘，35.3万载重吨。

2010年4月，公司签订了建造6艘4.5万吨级散货船合同（同时还可选择增加建设2艘9.5万吨级新巴拿马型船舶）。

2010年8月，不含在建船舶，公司拥有运输船舶13艘，52.1万载重吨，均为沿海、远洋运输船舶。

    公司自50年成立以来，经过几代省轮人的不懈努力，船队从小到大，船队从以木质内河货船为主发展到以现代化的大型远洋散货船为主，航线从闽江内河航线不断拓展到沿海、近洋和远洋航线，航线遍及中国大陆沿海各港和香港、台湾地区以及俄罗斯、韩国、日本、东南亚、欧洲等20多个国家的100多个港口。